Este proyecto comenzó a gestarse tras conseguir el Ayuntamiento la titularidad municipal del conjunto de la obra del Museo Mariano Benlliure. El 10 de diciembre de 2001 tras casi tres años de intensas negociaciones, se firmó con Alvaro Magro el “Convenio de reconocimiento de la titularidad municipal” gracias al cual 330 escayolas, esculturas, relieves y piezas en bronce originales de Benlliure pasaron definitivamente a propiedad del Ayuntamiento, además de 3 imágenes emblemáticas en las procesiones de Semana Santa, estas últimas por 426.718,60 €, dando solución a la precariedad en la titularidad de los fondos que durante cuarenta años hubo, ya que quien gestionó su adquisición y creó el primer museo fue la familia de Alvaro Magro, vinculada a Benlliure.
Se hacía necesario reformar el anexo del museo, así como abandonar la cripta de la iglesia, en donde las humedades estaban perjudicando las obras, y por ello se adquirió una vivienda colindante al anexo con 142,2 m2 de planta.
En 2002 se consiguió una subvención de la Conselleria de Cultura de la Generalitat y en 2003 del Ministerio de Fomento del 1% Cultural estatal.
Además de la obra, se adjudicó a otra empresa especializada el proyecto de implantación museográfico interior.
Durante la pasada Corporación, la empresa de la construcción OTÓN S.L. acabó la obra pero los trabajos de implantación museográfica interior se paralizaron por la otra empresa adjudicataria “ACESINH S.L.”, debido a dificultades económicas producidas por el impago a ésta de trabajos por parte de otras entidades, debido a la crisis económica. El Ayuntamiento tuvo que anular el contrato, tras un complejo procedimiento administrativo, y continuar los trabajos pendientes adjudicando contratos menores y de servicios a los subcontratistas de la empresa que ya tenían el encargo inicialmente concedido por la empresa principal, con el fin de abaratar costes y agilizar la ejecución.
El proyecto museográfico fue ampliado, por la necesidad de incluir el coste del anclaje de piezas especiales en las paredes que no estaba en el proyecto museográfico inicial, pues debía ejecutarse durante la instalación del equipamiento y mobiliario según el diseño elegido tras el concurso.
Además en 2009 se firmó un convenio entre el Ayuntamiento y el Instituto Valenciano de Conservación y Restauración, dependiente de la Conselleria de Cultura, para restaurar 127 piezas del Museo Benlliure con un coste de 57.300,96 €. La restauración fue subvencionada al 50% por el Instituto Valenciano . También se desarrollaron trabajos de inventariado y catalogación del archivo museístico, poniéndolos al día, con un coste que asumió íntegramente el Ayuntamiento de 43.671,98 €.
Este proyecto ha tenido un coste total de 1.483.668,61 € del que el 32% han sido subvenciones, por valor de 470.395 €, aportando el Ayuntamiento el 68% restante con 1.013.274 €. La obra ha tenido una subvención del 16,29% de la Conselleria de Cultura – Generalitat con 210.354,24 €, y el 17,91% de subvención del Ministerio de Fomento con 231.390,00 € a través del 1% Cultural, mientras que la restauración fue subvencionada al 50% por el Instituto Valenciano de Restauración de la Conselleria de Cultura con 28.650,48 €.
